Les sols du parc national remontent à l‘étage médjanien de l‘éocène supérieur. Les sédiments oligocènes sont la base de la structure géologique de cette zone. Ils sont développés en faciès numidien. Les sols sont peu évolués, d’apport colluvial. Ce sont des sols non carbonatés. Ils sont assez maigres, peu profonds, jalonnés souvent par la roche mère et entrecoupés d’escarpements rocheux avec des hauteurs considérables.
Trois types de versants délimitent grossièrement la cédraie, il s’agit des versants nord, sud et ouest. Le versant nord est le plus froid et le plus humide et présente toutes les caractéristiques esthétiques naturelles de la cédraie. L’altitude du point le moins élevé du parc national est de 862 m. Ras-el-Braret est le point culminant de ce massif, avec une altitude de 1787 m. Il constitue ainsi le troisième point culminant du massif du Ouarsenis. La belle clairière du Rond-point présente une altitude de 1461 mètres.
Au parc national de Théniet El Had, la strate arborée est représenté principalement par le cèdre de l’Atlas (Cedrus atlantica), le chêne zéen (Quercus canariensis), le chêne vert (Quercus rotundifolia) et le chêne liège (Quercus suber). Nous y rencontrons, avec une moindre importance, le genévrier oxycédre (Juniperus oxycedrus), le pistachier de l’Atlas (Pistachia atlantica), l‘érable de Montpellier (Acer monspessulanum), le frêne commun (Fraxinus angustifolia), l’orme champêtre (Ulmus campestris) et le merisier (Prunus avium).
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